中期阶段的少年三国志2开放了多款区别于新手基础副本的全新游戏模式，涵盖策略推关、跨服团队竞技、模拟经营养成、赛季跨区合作以及特殊规则挑战五大类内容，这些玩法既是稀有养成资源的主要产出渠道，也让整体游戏从单一推图转变为策略搭配与团队协作并行的体验，只有吃透各类玩法规则，才能稳步拉开战力差距，拿到普通日常副本无法获取的专属道具与赛季奖励。
临军斗阵是中期最先解锁的单人策略闯关模式，整体分为智略斗阵和妙影斗阵两种内容交替轮换开放，前者专门产出军师进阶与升级材料，后者用于红颜角色养成，每日固定拥有两次免费挑战机会，闯关时不需要从头重复战斗，系统会记录最高通关进度，再次进入可以直接从已通关关卡下一关继续推进。闯关过程中可以解锁奇谋妙策和芳华妙术两套天赋树，点亮节点后可以为上阵队伍提供专属攻防加成，每一轮周期结束后，最高闯关层数会解锁一次性进度宝箱，挑战获得的货币可以在先机商店兑换军师战符、红颜配饰等稀缺道具，郡国排行榜还会根据闯关进度进行排名，排名靠前可以额外拿到专属头像框与大量元宝奖励，战力达标后尽量把关卡推进到上限，避免错过每期限定的养成物资。
筑城兴市作为常驻模拟经营玩法，打破了卡牌游戏只靠战斗拿资源的模式，解锁之后可以开辟专属领地，通过开垦土地修建府衙、工坊、商行、兵营等不同建筑，每一座建筑都会持续挂机产出突破石、战法碎片、兵符材料等基础资源，建筑等级越高，单位时间产出数量越多。府衙等级提升之后还能解锁更多领地板块，繁荣度不仅决定府衙升阶条件，还会参与全服城池繁荣排行，府衙二阶之后会解锁交易市场，市场内道具价格会产生涨跌波动，看准低价入手高阶养成材料，等到行情上涨再完成置换，可以不用消耗元宝拿到大量刚需道具，同时还能拜访其他玩家的城池领取点赞奖励，是不参与高强度对抗也能稳定提战的核心玩法。
决战定军山与焚营拔寨分别填补了多人竞技和跨服竞速的玩法空白，决战定军山采用五人组队的对战机制，分为攻城拔寨和斩将夺塔两种对战规则每日轮换，攻城模式需要队伍分成两条线路分头作战，率先摧毁敌方大本营即可获胜，斩将模式则分三条路线对抗，优先击破两座防御塔的队伍拿下胜利，如果对局出现平分，则所有玩家合并为同一条线路进行最终决战，对局结算发放的荣誉值可以兑换高阶战法与竞技称号。焚营拔寨会在逐鹿天下休赛期开放，属于逐鹿体系的延伸玩法，局内可以继承此前赛季的军备属性，同时打造全新的局内加成设施，关卡分为普通守兵、先锋营、白毦营和石门八阵四类目标，石门八阵每日重置军备组合，想要拿到全部神兵与神兽养成资源，需要分开准备常规阵容和逐鹿部队两套队伍进行挑战。
问鼎军势和卫戍灵迹先锋赛则属于更高层级的跨服赛季玩法，问鼎军势支持多个战区自主组建联盟共同参与赛季比拼，战区会根据过往成绩划分种子梯队，组队窗口期分为自由调整和锁定两个阶段，前期可以自由邀请、退出战区，锁定之后只能提交申请等待审批，赛季结束之后会根据军势整体战绩发放玉锭、限时金色称号和兵符灵石，灵石可以镶嵌在兵符上获得百分比属性加成。卫戍灵迹在基础积分赛结束后，排名前三十二的小队进入先锋淘汰赛，小队成员分为正赛队员和先锋队员，队长可以在开战前调整上阵人员，同时坚守、奇袭、遗计三种先锋策略会直接改变积分获取方式，兽灵效果在该玩法内全部失效，更加考验武将阵容本身的搭配与硬件实力，淘汰赛名次越高，赛季结算的神兽灵骨、高阶兵符碎片数量也就越多。
